23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1430 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1430  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000396179  normal  0.150397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1710  hypothetical protein  52.25 
 
 		 224 aa  251  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0344623  normal  0.96681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2935  hypothetical protein  51.8 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00068648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2599  hypothetical protein  49.77 
 
 		 219 aa  224  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1323  hypothetical protein  47.95 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2681  hypothetical protein  46.51 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140782  unclonable  0.0000421056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2614  hypothetical protein  46.51 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.234616  hitchhiker  0.0000133675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1373  hypothetical protein  47.66 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.48509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2788  hypothetical protein  46.73 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.0156454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1658  hypothetical protein  45.58 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2229  hypothetical protein  47.39 
 
 		 230 aa  201  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2875  hypothetical protein  46.98 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121619  hitchhiker  0.0000113263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1477  hypothetical protein  46.98 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1472  hypothetical protein  46.98 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00599836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1508  hypothetical protein  46.98 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1443  hypothetical protein  47.49 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000382578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00489  hypothetical protein  33.18 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0506  hypothetical protein  32.74 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1245  hypothetical protein  32.87 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0828  hypothetical protein  36.42 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  0.0747999 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0889  hypothetical protein  31.06 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003130  hypothetical protein  30.06 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000034584  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02707  hypothetical protein  28.21 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>