23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0889 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0889  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  490  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02707  hypothetical protein  56.56 
 
 
222 aa  275  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003130  hypothetical protein  58.74 
 
 
221 aa  268  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000034584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0506  hypothetical protein  33.83 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00489  hypothetical protein  39.39 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1323  hypothetical protein  30.69 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1430  hypothetical protein  31.06 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000396179  normal  0.150397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2599  hypothetical protein  27.4 
 
 
219 aa  85.5  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1443  hypothetical protein  31.03 
 
 
224 aa  79  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000382578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1710  hypothetical protein  31.84 
 
 
224 aa  79  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0344623  normal  0.96681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1373  hypothetical protein  30.16 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.48509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2935  hypothetical protein  31.36 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00068648  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1477  hypothetical protein  33.79 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2681  hypothetical protein  33.1 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140782  unclonable  0.0000421056 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1472  hypothetical protein  33.79 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00599836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1508  hypothetical protein  33.79 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2875  hypothetical protein  33.79 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121619  hitchhiker  0.0000113263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2614  hypothetical protein  32.39 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.234616  hitchhiker  0.0000133675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2788  hypothetical protein  32.39 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.0156454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0828  hypothetical protein  27.67 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  0.0747999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1658  hypothetical protein  31.65 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2229  hypothetical protein  34.81 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1245  hypothetical protein  27.78 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>