23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1710 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1710  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0344623  normal  0.96681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2935  hypothetical protein  72.07 
 
 		 225 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00068648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1323  hypothetical protein  57.49 
 
 		 231 aa  257  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1430  hypothetical protein  52.25 
 
 		 222 aa  251  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000396179  normal  0.150397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2599  hypothetical protein  55.02 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1373  hypothetical protein  55.5 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.48509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1658  hypothetical protein  53.42 
 
 		 243 aa  248  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2681  hypothetical protein  53.88 
 
 		 231 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140782  unclonable  0.0000421056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2614  hypothetical protein  53.88 
 
 		 231 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.234616  hitchhiker  0.0000133675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2788  hypothetical protein  53.81 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.0156454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1443  hypothetical protein  54.71 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000382578  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1477  hypothetical protein  52.68 
 
 		 227 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1472  hypothetical protein  52.68 
 
 		 227 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00599836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1508  hypothetical protein  52.68 
 
 		 227 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2875  hypothetical protein  52.68 
 
 		 227 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121619  hitchhiker  0.0000113263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2229  hypothetical protein  51.21 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1245  hypothetical protein  36.36 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00489  hypothetical protein  35.59 
 
 		 238 aa  121  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0506  hypothetical protein  34.25 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0828  hypothetical protein  35.06 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  0.0747999 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003130  hypothetical protein  32.09 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000034584  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0889  hypothetical protein  31.84 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02707  hypothetical protein  31.28 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>