55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1324 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1324  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0861  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00121544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.25 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.34 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.34 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.34 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.34 
 
 		 202 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.78 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  37 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.35 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.19 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.92 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.02 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.87 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.87 
 
 		 217 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.83 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  33.67 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  33.33 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  30.5 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  30.5 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  28.48 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  34.02 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  33.7 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.99 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.99 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.99 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.99 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  32.65 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  32.65 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  32.65 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  32.65 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  33.33 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  39.08 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  32.32 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.78 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.26 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1049  hypothetical protein  31.39 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0670  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.93 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  29.36 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  32.98 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1295  fxsA cytoplasmic membrane protein  33.08 
 
 		 177 aa  43.9  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.28 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  23.33 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.42 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.3 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  27.36 
 
 		 167 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.35 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.51 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.63 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.65 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  37.18 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  30.84 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  30.84 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.49 
 
 		 186 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>