15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0861 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0861  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  278  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00121544  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1324  FxsA cytoplasmic membrane protein  50 
 
 
141 aa  130  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1049  hypothetical protein  29.92 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.85 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.05 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  31.4 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  24.43 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.84 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  31.4 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.57 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  22.86 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.96 
 
 
196 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.57 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  31.37 
 
 
178 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.12 
 
 
205 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>