31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4387 on replicon NC_011664
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4428  TraH family protein  98.92 
 
 		 462 aa  941    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.679998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4512  TraH family protein  98.7 
 
 		 462 aa  937    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.732355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4387  TraH family protein  100 
 
 		 462 aa  949    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4619  TraH family protein  98.92 
 
 		 462 aa  940    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4527  TraH family protein  99.57 
 
 		 462 aa  945    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.40492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4433  TraH family protein  99.35 
 
 		 462 aa  943    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_17  conjugative transfer protein TraH  50.56 
 
 		 461 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0015  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  32.68 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4303  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  33.79 
 
 		 454 aa  255  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.713962  normal  0.0473808 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0004  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  33.81 
 
 		 501 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0028  hypothetical protein  33.26 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.709843  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0036  hypothetical protein  32.06 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3995  TraH family protein  30.22 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4237  hypothetical protein  28.6 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5382  TraH family protein  33.16 
 
 		 487 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.310478  normal  0.517796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2168  hypothetical protein  28.76 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355326  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1525  TraH family protein  29.86 
 
 		 482 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210964  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6814  TraH family protein  27.8 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2330  hypothetical protein  29.82 
 
 		 482 aa  133  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.309266  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2663  hypothetical protein  29.22 
 
 		 482 aa  133  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.325387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4168  TraH family protein  24.79 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.391423 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0188  type IV conjugative transfer system protein TraH  28.57 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000939253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0198  hypothetical protein  37.58 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2125  hypothetical protein  39.16 
 
 		 494 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0253  hypothetical protein  40 
 
 		 508 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3801  hypothetical protein  37.7 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.78733  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0375  sex pilus assembly protein  26.58 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0938  putative TraG  32.43 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6221  TraH family protein  27.73 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1067  pilus assembly protein TraH, putative  28.1 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.343455  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4271  hypothetical protein  28.83 
 
 		 464 aa  52  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00225897  normal  0.898728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>