31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6814 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6814  TraH family protein  100 
 
 		 481 aa  993    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31865  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4168  TraH family protein  50.11 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.391423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1525  TraH family protein  35.81 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210964  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2663  hypothetical protein  34.21 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.325387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2330  hypothetical protein  33.16 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.309266  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2168  hypothetical protein  31.21 
 
 		 478 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355326  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0004  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  30.4 
 
 		 501 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4303  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  34.83 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.713962  normal  0.0473808 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3995  TraH family protein  30.35 
 
 		 484 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5382  TraH family protein  27.69 
 
 		 487 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.310478  normal  0.517796 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0015  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  27.03 
 
 		 458 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4237  hypothetical protein  24.8 
 
 		 465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_17  conjugative transfer protein TraH  25.57 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4387  TraH family protein  27.8 
 
 		 462 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4512  TraH family protein  27.59 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.732355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4433  TraH family protein  27.59 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4527  TraH family protein  27.59 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.40492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4428  TraH family protein  27.59 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.679998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4619  TraH family protein  27.59 
 
 		 462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0028  hypothetical protein  27.91 
 
 		 454 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.709843  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0188  type IV conjugative transfer system protein TraH  29.43 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000939253 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0036  hypothetical protein  29.29 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0375  sex pilus assembly protein  34.44 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1067  pilus assembly protein TraH, putative  39.86 
 
 		 559 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.343455  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0938  putative TraG  46.39 
 
 		 488 aa  91.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6221  TraH family protein  31.54 
 
 		 493 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2125  hypothetical protein  32.89 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4271  hypothetical protein  26.17 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00225897  normal  0.898728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0198  hypothetical protein  34.01 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3801  hypothetical protein  28.81 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.78733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0253  hypothetical protein  37.27 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>