31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3995 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3995  TraH family protein  100 
 
 		 484 aa  998    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5382  TraH family protein  53.5 
 
 		 487 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.310478  normal  0.517796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2168  hypothetical protein  43.96 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355326  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4237  hypothetical protein  32.74 
 
 		 465 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0028  hypothetical protein  31.53 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.709843  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0015  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  32.54 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4303  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  35.47 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.713962  normal  0.0473808 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0004  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  31.83 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4512  TraH family protein  30.3 
 
 		 462 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.732355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4428  TraH family protein  30.43 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.679998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4527  TraH family protein  30.43 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.40492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4433  TraH family protein  30.43 
 
 		 462 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4387  TraH family protein  30.22 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4619  TraH family protein  30.22 
 
 		 462 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0036  hypothetical protein  28.6 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_17  conjugative transfer protein TraH  30.52 
 
 		 461 aa  179  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6814  TraH family protein  30.35 
 
 		 481 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31865  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4168  TraH family protein  28.85 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.391423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1525  TraH family protein  28.85 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210964  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2330  hypothetical protein  30.49 
 
 		 482 aa  153  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.309266  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2663  hypothetical protein  30.49 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.325387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0188  type IV conjugative transfer system protein TraH  31.66 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000939253 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0375  sex pilus assembly protein  32.01 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6221  TraH family protein  32.47 
 
 		 493 aa  90.5  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2125  hypothetical protein  35.83 
 
 		 494 aa  90.1  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3801  hypothetical protein  31.87 
 
 		 495 aa  86.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.78733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0198  hypothetical protein  27.34 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0253  hypothetical protein  27.34 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1067  pilus assembly protein TraH, putative  34.09 
 
 		 559 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.343455  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0938  putative TraG  30.72 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4271  hypothetical protein  30.58 
 
 		 464 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00225897  normal  0.898728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>