31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1067 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1067  pilus assembly protein TraH, putative  100 
 
 		 559 aa  1144    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.343455  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0375  sex pilus assembly protein  25.58 
 
 		 481 aa  104  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0188  type IV conjugative transfer system protein TraH  26.04 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000939253 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4168  TraH family protein  28.68 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.391423 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6814  TraH family protein  39.86 
 
 		 481 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31865  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6221  TraH family protein  40.38 
 
 		 493 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2168  hypothetical protein  34.78 
 
 		 478 aa  94.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355326  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0015  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  32.73 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0004  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  36.64 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3995  TraH family protein  34.09 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5382  TraH family protein  33.83 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.310478  normal  0.517796 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4303  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  36.19 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.713962  normal  0.0473808 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4271  hypothetical protein  30.87 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00225897  normal  0.898728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1525  TraH family protein  39.53 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210964  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2663  hypothetical protein  29.14 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.325387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2330  hypothetical protein  37.41 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.309266  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4237  hypothetical protein  31.91 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0938  putative TraG  30.63 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2125  hypothetical protein  31.19 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4527  TraH family protein  28.1 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.40492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4387  TraH family protein  28.1 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4428  TraH family protein  28.1 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.679998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4433  TraH family protein  28.1 
 
 		 462 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4512  TraH family protein  28.1 
 
 		 462 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.732355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4619  TraH family protein  28.1 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0198  hypothetical protein  30.77 
 
 		 494 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0253  hypothetical protein  30.77 
 
 		 508 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3801  hypothetical protein  29.51 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.78733  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0028  hypothetical protein  27.27 
 
 		 454 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.709843  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0036  hypothetical protein  25.9 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_17  conjugative transfer protein TraH  25.71 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>