31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6221 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6221  TraH family protein  100 
 
 
493 aa  998    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0375  sex pilus assembly protein  31.57 
 
 
481 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588066  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0188  type IV conjugative transfer system protein TraH  33.82 
 
 
477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000939253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1067  pilus assembly protein TraH, putative  40.38 
 
 
559 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.343455  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4168  TraH family protein  28.71 
 
 
468 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.391423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2168  hypothetical protein  36.6 
 
 
478 aa  93.6  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355326  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4237  hypothetical protein  25.59 
 
 
465 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6814  TraH family protein  31.54 
 
 
481 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31865  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0004  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  32.78 
 
 
501 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3995  TraH family protein  32.47 
 
 
484 aa  90.5  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5382  TraH family protein  33.52 
 
 
487 aa  90.1  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.310478  normal  0.517796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1525  TraH family protein  39.17 
 
 
482 aa  87  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210964  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0015  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  32.69 
 
 
458 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253255  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2663  hypothetical protein  37.5 
 
 
482 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.325387  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4303  conjugal transfer pilus assembly protein TraH  37 
 
 
454 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.713962  normal  0.0473808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2330  hypothetical protein  38.1 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.309266  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2125  hypothetical protein  27.78 
 
 
494 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0028  hypothetical protein  34.96 
 
 
454 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.709843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0198  hypothetical protein  25.47 
 
 
494 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0253  hypothetical protein  26.32 
 
 
508 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_17  conjugative transfer protein TraH  30.3 
 
 
461 aa  70.5  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0036  hypothetical protein  31.58 
 
 
458 aa  70.1  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3801  hypothetical protein  26.67 
 
 
495 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.78733  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4433  TraH family protein  28.57 
 
 
462 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4527  TraH family protein  28.57 
 
 
462 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.40492  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4619  TraH family protein  29.47 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4387  TraH family protein  27.73 
 
 
462 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4512  TraH family protein  28.57 
 
 
462 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.732355  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4428  TraH family protein  28.57 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.679998  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4271  hypothetical protein  28.06 
 
 
464 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00225897  normal  0.898728 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0938  putative TraG  21.69 
 
 
488 aa  57  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>