23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4170 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4170  putative transcription regulator with HTH domain protein  100 
 
 		 91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2285  hypothetical protein  71.43 
 
 		 105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698401  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1847  putative transcriptional regulator, XRE family  53.06 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2787  hypothetical protein  48.98 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457023 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5485  transcription regulator  49.02 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3932  helix-turn-helix domain-containing protein  53.06 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04055  Helix-turn-helix motif  46.94 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2129  transcription regulator containing HTH  47.06 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31920  transcritional regulatior protein  45.1 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0775  helix-turn-helix domain protein  44.68 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5232  putative transcription regulator with HTH domain protein  42.86 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0815  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0785237  hitchhiker  0.00186138 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5739  hypothetical protein  42.59 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4803  hypothetical protein  39.62 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1331  hypothetical protein  34.38 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1284  hypothetical protein  47.06 
 
 		 125 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0265  putative HTH-type transcriptional regulator ygjM  41.18 
 
 		 118 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2087  putative transcription regulator with HTH domain protein  40.82 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.850866  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2391  putative transcription regulator with HTH domain  35.85 
 
 		 127 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7326  putative transcription regulator with HTH domain protein  40.82 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2124  putative transcription regulator with HTH domain  44 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.689275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0231  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0167624 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4949  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.827096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>