23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1331 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1331  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0815  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0785237  hitchhiker  0.00186138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4242  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.022655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1615  putative transcription regulator with HTH domain  38.46 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.914841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7326  putative transcription regulator with HTH domain protein  44.23 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1847  putative transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0231  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0167624 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5485  transcription regulator  40.74 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3482  hypothetical protein  41.82 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0775  helix-turn-helix domain protein  36.54 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2087  putative transcription regulator with HTH domain protein  35.19 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.850866  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3283  hypothetical protein  38.18 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3932  helix-turn-helix domain-containing protein  38.18 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31920  transcritional regulatior protein  35.19 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2285  hypothetical protein  44.74 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698401  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5232  putative transcription regulator with HTH domain protein  34.62 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04055  Helix-turn-helix motif  36.54 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3905  putative transcription regulator with HTH domain  36.54 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4803  hypothetical protein  35.19 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4170  putative transcription regulator with HTH domain protein  44.74 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  38.81 
 
 		 401 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2141  hypothetical protein  36 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00270384 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4949  helix-turn-helix domain-containing protein  30.99 
 
 		 121 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.827096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>