41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3937 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3937  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0863886  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3755  hypothetical protein  96.55 
 
 
174 aa  346  8e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000456164  normal  0.156287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3811  hypothetical protein  96.55 
 
 
174 aa  346  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000267592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0513  hypothetical protein  95.98 
 
 
174 aa  346  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000397292  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3320  hypothetical protein  84.48 
 
 
174 aa  315  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0554  hypothetical protein  85.06 
 
 
174 aa  313  9e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0553  hypothetical protein  85.06 
 
 
174 aa  313  9e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000454785  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3476  hypothetical protein  84.48 
 
 
174 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0554  hypothetical protein  82.18 
 
 
174 aa  310  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3725  hypothetical protein  63.79 
 
 
174 aa  256  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0607  hypothetical protein  66.09 
 
 
174 aa  251  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4346  hypothetical protein  65.52 
 
 
174 aa  249  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3528  hypothetical protein  65.52 
 
 
174 aa  245  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3154  hypothetical protein  60.92 
 
 
174 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0435  hypothetical protein  64.37 
 
 
173 aa  235  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0662  hypothetical protein  56.74 
 
 
177 aa  198  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0781  hypothetical protein  44.38 
 
 
178 aa  167  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.946509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3370  hypothetical protein  42.94 
 
 
181 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  0.288498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03075  hypothetical protein  35.06 
 
 
191 aa  104  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0446  hypothetical protein  36.3 
 
 
187 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01743  hypothetical protein  40.94 
 
 
172 aa  97.4  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00519538  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3567  hypothetical protein  35.09 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00374365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0968  hypothetical protein  34.32 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0825  hypothetical protein  32.95 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0369421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0667  hypothetical protein  29.55 
 
 
201 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.641844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0410  hypothetical protein  30.43 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4423  hypothetical protein  36.36 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0940793  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4887  hypothetical protein  31.21 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  0.873613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4237  hypothetical protein  30.81 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1711  hypothetical protein  34.95 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.495547  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4933  hypothetical protein  35.45 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.19497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3197  hypothetical protein  26.51 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0340  hypothetical protein  27.54 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.844466  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0329  hypothetical protein  27.54 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1980  hypothetical protein  26.95 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.27976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1816  hypothetical protein  32.14 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35440  hypothetical protein  23.7 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2052  hypothetical protein  33.94 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2802  hypothetical protein  27.89 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218116  normal  0.415128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1446  hypothetical protein  22.16 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  30.26 
 
 
3608 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>