40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0446 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0446  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  377  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03075  hypothetical protein  55.68 
 
 
191 aa  207  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0667  hypothetical protein  41.38 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.641844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0410  hypothetical protein  38.95 
 
 
204 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4346  hypothetical protein  34.25 
 
 
174 aa  118  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0825  hypothetical protein  40.29 
 
 
174 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0369421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3937  hypothetical protein  35.43 
 
 
174 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0863886  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3755  hypothetical protein  34.86 
 
 
174 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000456164  normal  0.156287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3725  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3811  hypothetical protein  34.86 
 
 
174 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000267592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0513  hypothetical protein  34.86 
 
 
174 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000397292  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3320  hypothetical protein  33.91 
 
 
174 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1816  hypothetical protein  40.68 
 
 
168 aa  104  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3154  hypothetical protein  32.58 
 
 
174 aa  104  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0607  hypothetical protein  33.71 
 
 
174 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0340  hypothetical protein  35.96 
 
 
194 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.844466  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0553  hypothetical protein  33.91 
 
 
174 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000454785  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0329  hypothetical protein  35.03 
 
 
194 aa  99  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0435  hypothetical protein  32.77 
 
 
173 aa  98.6  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3476  hypothetical protein  32.76 
 
 
174 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0554  hypothetical protein  32.76 
 
 
174 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0554  hypothetical protein  33.71 
 
 
174 aa  97.8  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0781  hypothetical protein  31.84 
 
 
178 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.946509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3528  hypothetical protein  31.98 
 
 
174 aa  90.9  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0662  hypothetical protein  30.86 
 
 
177 aa  89  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1980  hypothetical protein  33.81 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.27976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2802  hypothetical protein  31.55 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218116  normal  0.415128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3567  hypothetical protein  31.52 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00374365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3370  hypothetical protein  26.6 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  0.288498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4237  hypothetical protein  31.32 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3197  hypothetical protein  29.67 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35440  hypothetical protein  30.27 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1711  hypothetical protein  31.93 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.495547  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01743  hypothetical protein  26.49 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00519538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0968  hypothetical protein  27.62 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4933  hypothetical protein  31.16 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.19497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2052  hypothetical protein  30.57 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4423  hypothetical protein  29.71 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0940793  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4887  hypothetical protein  28.99 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  0.873613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1446  hypothetical protein  26.35 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>