40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0968 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0968  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  345  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01743  hypothetical protein  42.48 
 
 
172 aa  128  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00519538  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3567  hypothetical protein  38.6 
 
 
177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00374365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0435  hypothetical protein  39.05 
 
 
173 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0553  hypothetical protein  35.12 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000454785  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3755  hypothetical protein  34.91 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000456164  normal  0.156287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0607  hypothetical protein  34.52 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3811  hypothetical protein  34.91 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000267592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0513  hypothetical protein  34.91 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000397292  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0554  hypothetical protein  35.71 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3725  hypothetical protein  36.31 
 
 
174 aa  95.9  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3320  hypothetical protein  34.68 
 
 
174 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3476  hypothetical protein  34.91 
 
 
174 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0554  hypothetical protein  34.32 
 
 
174 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3528  hypothetical protein  33.96 
 
 
174 aa  94  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3937  hypothetical protein  34.32 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0863886  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0662  hypothetical protein  38.41 
 
 
177 aa  87.4  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3154  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4346  hypothetical protein  35.77 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0825  hypothetical protein  31.76 
 
 
174 aa  84.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0369421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03075  hypothetical protein  33.11 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0781  hypothetical protein  29.94 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.946509  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1980  hypothetical protein  31.25 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.27976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0446  hypothetical protein  28.19 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0410  hypothetical protein  32.85 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3370  hypothetical protein  30.56 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  0.288498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0667  hypothetical protein  32.85 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.641844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3197  hypothetical protein  29.22 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1816  hypothetical protein  31.82 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1711  hypothetical protein  30.56 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.495547  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4237  hypothetical protein  35.4 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0340  hypothetical protein  25.58 
 
 
194 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.844466  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0329  hypothetical protein  27.34 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4887  hypothetical protein  28.67 
 
 
172 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  0.873613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4933  hypothetical protein  30.56 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.19497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4423  hypothetical protein  28.67 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0940793  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2052  hypothetical protein  32.11 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35440  hypothetical protein  29.59 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2802  hypothetical protein  25.45 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218116  normal  0.415128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1446  hypothetical protein  23.71 
 
 
182 aa  41.2  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>