40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0607 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0607  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  353  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4346  hypothetical protein  72.41 
 
 		 174 aa  273  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3725  hypothetical protein  66.67 
 
 		 174 aa  262  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0513  hypothetical protein  67.24 
 
 		 174 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000397292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3755  hypothetical protein  67.24 
 
 		 174 aa  254  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000456164  normal  0.156287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3811  hypothetical protein  67.24 
 
 		 174 aa  254  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000267592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3320  hypothetical protein  65.52 
 
 		 174 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3937  hypothetical protein  66.09 
 
 		 174 aa  251  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0863886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0553  hypothetical protein  66.09 
 
 		 174 aa  250  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0554  hypothetical protein  65.52 
 
 		 174 aa  249  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0435  hypothetical protein  68.39 
 
 		 173 aa  249  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3476  hypothetical protein  65.52 
 
 		 174 aa  246  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0554  hypothetical protein  64.94 
 
 		 174 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3154  hypothetical protein  55.17 
 
 		 174 aa  220  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3528  hypothetical protein  56.9 
 
 		 174 aa  214  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0662  hypothetical protein  59.67 
 
 		 177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0781  hypothetical protein  42.61 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.946509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3370  hypothetical protein  39.66 
 
 		 181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  0.288498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03075  hypothetical protein  33.53 
 
 		 191 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0968  hypothetical protein  34.52 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3567  hypothetical protein  38.03 
 
 		 177 aa  95.5  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00374365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  95.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0410  hypothetical protein  33.09 
 
 		 204 aa  91.3  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01743  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00519538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0667  hypothetical protein  30.67 
 
 		 201 aa  87.8  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3197  hypothetical protein  27.49 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0825  hypothetical protein  30.64 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4237  hypothetical protein  31.54 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0340  hypothetical protein  26.62 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.844466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0329  hypothetical protein  26.62 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1711  hypothetical protein  28.82 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.495547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1980  hypothetical protein  28.26 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.27976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4423  hypothetical protein  32.73 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0940793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1816  hypothetical protein  30.28 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4887  hypothetical protein  32.73 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  0.873613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4933  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35440  hypothetical protein  25.9 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2802  hypothetical protein  26.76 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218116  normal  0.415128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2052  hypothetical protein  33.64 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1446  hypothetical protein  21.74 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>