40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2802 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2802  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  352  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218116  normal  0.415128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35440  hypothetical protein  46.43 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1980  hypothetical protein  46.58 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.27976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1711  hypothetical protein  35.93 
 
 		 201 aa  95.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.495547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2052  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0446  hypothetical protein  35.37 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0825  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  84.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4423  hypothetical protein  37.84 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0940793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4887  hypothetical protein  36.91 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  0.873613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03075  hypothetical protein  34.97 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0667  hypothetical protein  36.67 
 
 		 201 aa  77.4  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4933  hypothetical protein  35.92 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19497 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1816  hypothetical protein  34.59 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4346  hypothetical protein  29.08 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1446  hypothetical protein  33.11 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4237  hypothetical protein  31.71 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0410  hypothetical protein  33.55 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3567  hypothetical protein  29.07 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00374365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3755  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000456164  normal  0.156287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0513  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000397292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3811  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000267592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0781  hypothetical protein  25.29 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.946509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3937  hypothetical protein  27.89 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0863886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3320  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0662  hypothetical protein  27.46 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0553  hypothetical protein  26.06 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01743  hypothetical protein  28.03 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00519538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0607  hypothetical protein  26.76 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3528  hypothetical protein  21.21 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0554  hypothetical protein  26.71 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3476  hypothetical protein  26.71 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0554  hypothetical protein  24.82 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0340  hypothetical protein  28.67 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.844466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3154  hypothetical protein  23.94 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0968  hypothetical protein  25.45 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0329  hypothetical protein  28 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3370  hypothetical protein  23.84 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  0.288498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0435  hypothetical protein  26.36 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3197  hypothetical protein  32.12 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3725  hypothetical protein  23.19 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>