36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1446 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1446  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  380  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1980  hypothetical protein  38.36 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.27976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4887  hypothetical protein  37.41 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  0.873613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4423  hypothetical protein  36.73 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0940793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4933  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1711  hypothetical protein  37.42 
 
 		 201 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.495547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2052  hypothetical protein  34.42 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4237  hypothetical protein  32.9 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2802  hypothetical protein  33.11 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218116  normal  0.415128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35440  hypothetical protein  31.95 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0825  hypothetical protein  28.48 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1816  hypothetical protein  30.89 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0781  hypothetical protein  28.47 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.946509  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03075  hypothetical protein  29.08 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0446  hypothetical protein  30.36 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3370  hypothetical protein  28.17 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  0.288498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0410  hypothetical protein  25.17 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3320  hypothetical protein  24.46 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01743  hypothetical protein  26.17 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00519538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0667  hypothetical protein  29.8 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3937  hypothetical protein  22.16 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0863886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0553  hypothetical protein  23.4 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0554  hypothetical protein  23.4 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3476  hypothetical protein  23.4 
 
 		 174 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3755  hypothetical protein  23.02 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000456164  normal  0.156287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0513  hypothetical protein  23.02 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000397292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3811  hypothetical protein  23.02 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000267592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3154  hypothetical protein  22.22 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3528  hypothetical protein  25.71 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4346  hypothetical protein  20.5 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3567  hypothetical protein  25.6 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00374365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0554  hypothetical protein  21.99 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0607  hypothetical protein  21.74 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3725  hypothetical protein  21.89 
 
 		 174 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0968  hypothetical protein  23.71 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0435  hypothetical protein  22.49 
 
 		 173 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>