256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3849 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009426  Saro_3849  ferredoxin  100 
 
 
93 aa  186  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.05965  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1473  ferredoxin  43 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1325  ferredoxin  48.15 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0217  ferredoxin  43.75 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2965  ferredoxin  44.3 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611934  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0213  ferredoxin  41.77 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574609  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2790  ferredoxin  43.21 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4625  ferredoxin  43.04 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5686  ferredoxin  43.04 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3549  ferredoxin  43.04 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171843  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.46 
 
 
348 aa  60.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
323 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
323 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
323 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
323 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
323 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1377  ferredoxin  41.25 
 
 
344 aa  57.4  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1354  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.79 
 
 
360 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
322 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
322 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1656  ferredoxin/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  40.79 
 
 
342 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
322 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  42.11 
 
 
322 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
322 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
322 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1567  putative flavodoxin oxidoreductase  32.56 
 
 
327 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
322 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  42.11 
 
 
322 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  42.11 
 
 
322 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.96 
 
 
338 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  35.96 
 
 
338 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.83 
 
 
345 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.2 
 
 
349 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3094  ferredoxin  51.14 
 
 
119 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3357  ferredoxin  38.27 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2278  hypothetical protein  55.26 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.51 
 
 
341 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  44.29 
 
 
322 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  32.18 
 
 
366 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.44 
 
 
348 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.14 
 
 
397 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  37.5 
 
 
342 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  40.91 
 
 
334 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.56 
 
 
341 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  31.71 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0368  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.93 
 
 
349 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000152179  unclonable  0.0000000536211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08710  ferredoxin, XylT  53.73 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1770  putative flavodoxin oxidoreductase  30.11 
 
 
486 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0104473  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  32.26 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.84 
 
 
339 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.44 
 
 
350 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.74 
 
 
350 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3312  hypothetical protein  45.45 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.09 
 
 
357 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.44 
 
 
349 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  35.23 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35 
 
 
340 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.56 
 
 
349 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  32.29 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.44 
 
 
349 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  33.33 
 
 
336 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3791  ferredoxin  47.5 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108252  hitchhiker  0.00246562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  30.77 
 
 
350 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
336 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1650  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.23 
 
 
351 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.704369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  32.26 
 
 
365 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  33.73 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.26 
 
 
365 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  31.65 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  28.87 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  28.87 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.67 
 
 
337 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 
343 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 
343 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 
343 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 
343 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 
343 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  48.08 
 
 
333 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 
343 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 
343 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 
343 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  37.93 
 
 
334 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  43.4 
 
 
337 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.75 
 
 
350 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.53 
 
 
338 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  29.41 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.03 
 
 
702 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1299  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.33 
 
 
928 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  29.47 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  32.22 
 
 
356 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.25 
 
 
342 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.57 
 
 
354 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.8 
 
 
343 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.96 
 
 
332 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.16 
 
 
929 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  31.25 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  37.18 
 
 
338 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 
346 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 
346 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
350 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>