50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3275 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.99 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.41 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.31 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.33 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.15 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.15 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  38.17 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  37.76 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.15 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.8 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  41.63 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.83 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  37.76 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  32.47 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  34.83 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  31.6 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  34.33 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  32.51 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  32.51 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  32.51 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  32.51 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  32.51 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  31.5 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  31.5 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  31.5 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  31.5 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  31.5 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  31.5 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  31.5 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  31.5 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  31.5 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  30.84 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  32.08 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  30.33 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  30.84 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  30.84 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  32.23 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  31.11 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  31.91 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.95 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  28.89 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.51 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1443  PAP2 family protein  29.07 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253975  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.67 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.8 
 
 		 176 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1321  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.29 
 
 		 238 aa  42.4  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.175223  normal  0.0541289 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  31.4 
 
 		 215 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1183  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  30.23 
 
 		 205 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1181  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  30.23 
 
 		 205 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>