96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4154 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  72.18 
 
 
257 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.28 
 
 
250 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  51.06 
 
 
271 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  50.64 
 
 
265 aa  235  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  49.58 
 
 
274 aa  234  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.12 
 
 
260 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.08 
 
 
285 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.84 
 
 
285 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.84 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  48.28 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.12 
 
 
269 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.61 
 
 
255 aa  185  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  42.31 
 
 
260 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  30.17 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  30.17 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  30.17 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  32.41 
 
 
257 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  29.56 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  29.31 
 
 
258 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  31.65 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  31.65 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  31.65 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  31.65 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  31.65 
 
 
254 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  31.65 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  33.17 
 
 
259 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  31.65 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  31.65 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  31.65 
 
 
254 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  29.95 
 
 
258 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  30.81 
 
 
257 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  32.61 
 
 
254 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  32.61 
 
 
254 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  32.61 
 
 
254 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  32.61 
 
 
254 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  32.61 
 
 
254 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  27.09 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  26.92 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  31.76 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  26 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.54 
 
 
179 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.8 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.91 
 
 
157 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  41.1 
 
 
138 aa  52  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.94 
 
 
169 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.33 
 
 
172 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  30.49 
 
 
215 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
169 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.62 
 
 
172 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0783  PAP2 family protein  30.61 
 
 
193 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1379  PAP2 family protein  28.74 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207863 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1203  PAP2 family protein  28.74 
 
 
205 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1301  PAP2 family protein  28.74 
 
 
205 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4003  PAP2 family protein  26.83 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1443  PAP2 family protein  25.93 
 
 
214 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.52 
 
 
187 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.64 
 
 
187 aa  45.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.74 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.43228  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.84 
 
 
178 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1402  PAP2 family protein  25.61 
 
 
205 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.84 
 
 
178 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  32.93 
 
 
187 aa  45.8  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0795  PAP2 family protein  29.59 
 
 
193 aa  45.4  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0176796  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.06 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1181  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  28.24 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1183  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  28.24 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.06 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  36 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.25 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1205  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.4 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.38 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0817  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.35 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.71 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.06 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.06 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  36.51 
 
 
170 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.8 
 
 
182 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6692  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.11 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.71 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4755  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00150549  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.99 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.33 
 
 
181 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  33.33 
 
 
182 aa  42.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  30.68 
 
 
439 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.36 
 
 
170 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.62 
 
 
251 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2335  PAP2 family protein  34.12 
 
 
213 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0634  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.48 
 
 
217 aa  42  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2342  PAP2 family protein  34.12 
 
 
213 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2417  PAP2 family protein  34.12 
 
 
213 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2154  PAP2 family protein  34.12 
 
 
213 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2309  PAP2 family protein  34.12 
 
 
213 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2088  phosphatidylglycerophosphatase B  34.12 
 
 
213 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0563174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2092  phosphatidylglycerophosphatase B  34.12 
 
 
213 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>