215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0302 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 255 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.28 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.92 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.84 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  44 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  43.82 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  43.2 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.05 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.86 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  42.75 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.68 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.28 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.91 
 
 		 285 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  45.07 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  33.19 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  31.9 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  31.76 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  35.1 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  30.74 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  30.74 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  30.74 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  30.74 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  30.74 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  30.74 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  30.74 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  30.74 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  30.74 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  31.8 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  30.9 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  30.04 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  34.85 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  30.04 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  33.49 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  30.04 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  30.04 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  30.04 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  34.85 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  34.85 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  32.7 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  26.6 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.79 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  30.4 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1402  PAP2 family protein  28.46 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  32.58 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1443  PAP2 family protein  29.21 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.66 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4003  PAP2 family protein  31.15 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.16 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1379  PAP2 family protein  30.34 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207863 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1203  PAP2 family protein  30.34 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1301  PAP2 family protein  30.34 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1181  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  29.21 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1183  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  29.21 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 		 187 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.69 
 
 		 169 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.36 
 
 		 320 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.71 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.22 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.58 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.43228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.47 
 
 		 179 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  46.67 
 
 		 138 aa  52.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.98 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.68 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0678  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.22 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.62 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  38.96 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.25 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  37.84 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  36.25 
 
 		 438 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.05 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.25 
 
 		 438 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.88 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.75 
 
 		 182 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.25 
 
 		 438 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.54 
 
 		 187 aa  49.7  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  35.48 
 
 		 227 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.25 
 
 		 438 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.06 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1362  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.65 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.31 
 
 		 170 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  35.24 
 
 		 178 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.85 
 
 		 172 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.66 
 
 		 178 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.66 
 
 		 178 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1205  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.34 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.88 
 
 		 360 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.48 
 
 		 232 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.86 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.68 
 
 		 174 aa  48.9  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.71 
 
 		 438 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.11 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.92 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.85 
 
 		 176 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1390  PAP2 family protein  37.33 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.686909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  37.68 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  41.38 
 
 		 812 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.69 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.29 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.56 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>