64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1506 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  99.61 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  75.59 
 
 		 257 aa  410  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  68.9 
 
 		 257 aa  358  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 		 258 aa  333  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  62.15 
 
 		 258 aa  328  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  57.31 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  57.31 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  57.31 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  49.8 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  50.61 
 
 		 259 aa  222  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  37.22 
 
 		 245 aa  142  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.03 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.65 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  30.29 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  29.88 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.59 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.47 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  31.28 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  29.88 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.86 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.42 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.22 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  32.42 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  35.86 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.09 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  33.96 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  34.07 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.71 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  31.86 
 
 		 437 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  30.97 
 
 		 437 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.17 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  37.5 
 
 		 138 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3685  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.17 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000286465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1502  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.77 
 
 		 224 aa  45.4  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00788847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.28 
 
 		 245 aa  45.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.51 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.32 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  37.1 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15070  PAP2 superfamily protein  27.17 
 
 		 198 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.872818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  37.5 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  34.57 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.49 
 
 		 183 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.17 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.88 
 
 		 179 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.17 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3450  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.97 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.25 
 
 		 171 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0508  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.67 
 
 		 212 aa  42  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2064  PAP2 family protein  26.97 
 
 		 305 aa  42  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0267151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>