89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0462 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  72.18 
 
 
256 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.39 
 
 
250 aa  275  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  51.91 
 
 
271 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  51.49 
 
 
265 aa  235  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  51.49 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.05 
 
 
285 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.85 
 
 
260 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.42 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  51.27 
 
 
269 aa  219  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.42 
 
 
285 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  51.72 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.69 
 
 
255 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  43.75 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  29.27 
 
 
258 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  31.7 
 
 
253 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  31.7 
 
 
253 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  31.7 
 
 
253 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  30.36 
 
 
258 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  31.25 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  33.7 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  33.7 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  33.7 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  33.7 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  33.7 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  33.7 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  29.79 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  33.7 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  33.7 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  33.7 
 
 
254 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  30.8 
 
 
254 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  30.8 
 
 
254 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  30.8 
 
 
254 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  30.8 
 
 
254 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  30.8 
 
 
254 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  30.3 
 
 
257 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  34.27 
 
 
259 aa  99  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  28.93 
 
 
245 aa  87  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  28.25 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  25.93 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  25.6 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  27.47 
 
 
232 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.91 
 
 
157 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.19 
 
 
179 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  43.06 
 
 
138 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.67 
 
 
172 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.82 
 
 
187 aa  49.3  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.36 
 
 
169 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.44 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.44 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0817  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.86 
 
 
179 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0783  PAP2 family protein  30.61 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.21 
 
 
172 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.72 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  33.78 
 
 
171 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  32.47 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1379  PAP2 family protein  29.76 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207863 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.93 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.21 
 
 
182 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.89 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.75 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.94 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.03 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  28.38 
 
 
182 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4003  PAP2 family protein  32.47 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1301  PAP2 family protein  29.76 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1203  PAP2 family protein  29.76 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  32.93 
 
 
187 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.06 
 
 
176 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.14 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  41.89 
 
 
175 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.89 
 
 
170 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  32.93 
 
 
812 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0795  PAP2 family protein  29.59 
 
 
193 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0176796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.19 
 
 
169 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.39 
 
 
187 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  35.8 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.71 
 
 
209 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.49 
 
 
215 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.43228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.58 
 
 
170 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  38.24 
 
 
296 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.21 
 
 
170 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0678  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.72 
 
 
208 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.21 
 
 
170 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4970  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.78 
 
 
296 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1402  PAP2 family protein  29.87 
 
 
205 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.43 
 
 
222 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.91 
 
 
194 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.67 
 
 
181 aa  42  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>