63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1620 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  82.28 
 
 		 254 aa  431  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  82.68 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  81.5 
 
 		 257 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  70.47 
 
 		 257 aa  359  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  64.14 
 
 		 258 aa  332  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 		 258 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  58.1 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  58.1 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  58.1 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  52.32 
 
 		 257 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  57.02 
 
 		 259 aa  234  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  34.22 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.47 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.09 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.06 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.61 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.87 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  34.43 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  30.4 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.81 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  29.65 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  29.13 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  32.97 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  33.52 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.02 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  30.56 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  31.29 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.25 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  38.89 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  32.74 
 
 		 437 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  31.86 
 
 		 437 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.2 
 
 		 157 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0508  membrane-associated phospholipid phosphatase  37.35 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3685  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.53 
 
 		 299 aa  45.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000286465  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.25 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.25 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.03 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.71 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.38 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  40.3 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.71 
 
 		 183 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.38 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.68 
 
 		 241 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15070  PAP2 superfamily protein  24.49 
 
 		 198 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.872818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 		 179 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.12 
 
 		 172 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24850  membrane-associated phospholipid phosphatase  25.42 
 
 		 285 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  37.1 
 
 		 248 aa  42  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.91 
 
 		 199 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>