60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2652 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  94.96 
 
 
258 aa  497  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  67.06 
 
 
257 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  63.35 
 
 
254 aa  333  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  63.35 
 
 
254 aa  333  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 
254 aa  333  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 
254 aa  333  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 
254 aa  333  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 
254 aa  333  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 
254 aa  333  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 
254 aa  333  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  64.14 
 
 
254 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  64.14 
 
 
254 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  64.14 
 
 
254 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  64.14 
 
 
254 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  64.14 
 
 
254 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  62.95 
 
 
254 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  61.87 
 
 
257 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  62 
 
 
253 aa  324  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  62 
 
 
253 aa  324  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  62 
 
 
253 aa  324  8.000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  60.34 
 
 
257 aa  300  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  54.82 
 
 
259 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  36.6 
 
 
245 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.46 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.02 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.95 
 
 
256 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.16 
 
 
260 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.34 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.81 
 
 
285 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  28.1 
 
 
271 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  27.69 
 
 
265 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.58 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.23 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  32.29 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  27.57 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  27.5 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  32.79 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.56 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  32.2 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.09 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  29.38 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  40.85 
 
 
299 aa  48.9  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  36.99 
 
 
138 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.9 
 
 
157 aa  45.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.08 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1046  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.73 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0877  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.58 
 
 
322 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.8 
 
 
179 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  29.73 
 
 
437 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.41 
 
 
187 aa  42.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.78 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0508  membrane-associated phospholipid phosphatase  22.12 
 
 
212 aa  42.7  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.7 
 
 
232 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  29.27 
 
 
204 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  29.27 
 
 
204 aa  42.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  30.95 
 
 
437 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.81 
 
 
194 aa  42.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  37.7 
 
 
248 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>