111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0369 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  97.05 
 
 		 271 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  96.6 
 
 		 265 aa  508  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  85.08 
 
 		 260 aa  400  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  74.91 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  75.29 
 
 		 285 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  74.53 
 
 		 285 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  75.2 
 
 		 260 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  72.97 
 
 		 269 aa  350  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.58 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.49 
 
 		 257 aa  225  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.61 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  39.07 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  32.38 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  32.57 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  29.88 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  29.88 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  29.88 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  29.88 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  29.88 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  29.88 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  29.88 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  29.88 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  29.88 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  29.44 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  29.44 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  29.44 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  32.39 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  27.16 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  27.57 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  31.13 
 
 		 259 aa  95.5  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  29.13 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  29.13 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  29.13 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  29.13 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  29.13 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  29.34 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  32.53 
 
 		 253 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  30.93 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.1 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  28.22 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.37 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.59 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.59 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.4 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.16 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  41.56 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  34.62 
 
 		 199 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36 
 
 		 179 aa  49.3  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.76 
 
 		 176 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.62 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.35 
 
 		 169 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  35.56 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.84 
 
 		 187 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.98 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  31.68 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  34.26 
 
 		 439 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  38.36 
 
 		 175 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.16 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.62 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.65 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  36.05 
 
 		 438 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.61 
 
 		 438 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11398  Phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  34.07 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.924537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.07 
 
 		 169 aa  45.8  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.75 
 
 		 360 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.73 
 
 		 174 aa  45.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35 
 
 		 438 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  37.8 
 
 		 219 aa  45.4  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  30.77 
 
 		 199 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.93 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.69 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.69 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.67 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  29.73 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  39.33 
 
 		 502 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.65 
 
 		 457 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1093  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.33 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00170585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.59 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.81 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4003  PAP2 family protein  29.76 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.11 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.39 
 
 		 171 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1205  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.95 
 
 		 215 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 		 196 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  33.71 
 
 		 438 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0783  PAP2 family protein  29.47 
 
 		 193 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.39 
 
 		 182 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.71 
 
 		 438 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.9 
 
 		 199 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.71 
 
 		 438 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.7 
 
 		 438 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  29.76 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.82 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.67 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0055  undecaprenyl-diphosphatase  43.94 
 
 		 200 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.11 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  37.5 
 
 		 423 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>