106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1917 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 
253 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 
253 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 
253 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  63.64 
 
 
257 aa  340  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  62.95 
 
 
258 aa  328  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  62 
 
 
258 aa  324  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  58.1 
 
 
254 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  58.1 
 
 
254 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  58.1 
 
 
254 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  58.1 
 
 
254 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  58.1 
 
 
254 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  54.94 
 
 
257 aa  295  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  57.71 
 
 
254 aa  294  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  57.31 
 
 
254 aa  292  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  57.31 
 
 
254 aa  292  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  57.31 
 
 
254 aa  292  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  57.31 
 
 
254 aa  292  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  57.31 
 
 
254 aa  292  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  57.31 
 
 
254 aa  292  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  57.31 
 
 
254 aa  292  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  57.31 
 
 
254 aa  292  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  52.4 
 
 
257 aa  258  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  52.65 
 
 
259 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  34.32 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.01 
 
 
250 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.25 
 
 
257 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.17 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  28.97 
 
 
271 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  28.97 
 
 
265 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  29.44 
 
 
274 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.86 
 
 
269 aa  95.9  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.5 
 
 
285 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.5 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.76 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.02 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  35.03 
 
 
241 aa  92  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  29.11 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.54 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  32.42 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  38.46 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.8 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.42 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0270  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.3 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.62 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.86 
 
 
171 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  39.44 
 
 
138 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.57 
 
 
232 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  35.16 
 
 
437 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.74 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  36.71 
 
 
439 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.74 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.61 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  34.07 
 
 
437 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.54 
 
 
157 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.84 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0284  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.65 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.206751  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.14 
 
 
179 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.49 
 
 
182 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  39.34 
 
 
243 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.61 
 
 
255 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.61 
 
 
255 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.94 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.42 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.07 
 
 
438 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
358 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6692  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.28 
 
 
260 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 
172 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.14 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3685  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.56 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000286465  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  38.1 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  44.26 
 
 
359 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  44.26 
 
 
359 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.42 
 
 
458 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.74 
 
 
438 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.72 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.37 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  34.15 
 
 
438 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.89 
 
 
170 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
438 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
169 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.15 
 
 
438 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.1 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.66 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1018  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.62 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250416  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0501  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.18 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.66 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.87 
 
 
360 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  36.11 
 
 
170 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.84 
 
 
272 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.04 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  41.43 
 
 
357 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.49 
 
 
194 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.41 
 
 
187 aa  42.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0992  PAP2 family protein  34.18 
 
 
204 aa  42.4  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  35.14 
 
 
199 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2919  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.93 
 
 
293 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916002  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.26 
 
 
170 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.93 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  36.36 
 
 
203 aa  42  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>