48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06845 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  83.62 
 
 		 232 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  45.73 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  34.47 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  35.03 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  35.03 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  35.03 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  32.41 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  32 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  31.41 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  31.1 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  30.93 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  30.41 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  34.07 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  34.07 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  34.07 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  34.07 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  34.07 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  34.07 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  34.07 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  34.07 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  34.07 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  30.41 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  29.38 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  31.29 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  31.29 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  31.29 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  31.29 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  31.29 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  28.26 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.14 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  26.73 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.02 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.22 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.22 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  26.53 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  29.23 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.17 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.32 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.4 
 
 		 255 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.06 
 
 		 182 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.23 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  36.36 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9010  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.38 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.86 
 
 		 182 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>