65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000870 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  100 
 
 
232 aa  470  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  83.62 
 
 
241 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  45.45 
 
 
274 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  37.97 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
253 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
253 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
253 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  32.41 
 
 
257 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  28.71 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  33.99 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  29.12 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  31.68 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  27.19 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  29.14 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  27.94 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  28.83 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  28.38 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.23 
 
 
285 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  30.94 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  30.94 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  30.94 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  30.94 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  30.94 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  30.94 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  30.94 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  30.94 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  30.94 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.4 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  29.25 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  29.25 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  29.25 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  29.25 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  29.25 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.4 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.92 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.17 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  30.95 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  27.23 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.26 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.31 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.47 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.6 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.01 
 
 
182 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.64 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  35.96 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.01 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1321  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.38 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.175223  normal  0.0541289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  38.57 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.39 
 
 
157 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1093  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.71 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00170585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  34.09 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  34.09 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.47 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.89 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  29.67 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4035  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  29.67 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  32.95 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3000  PA-phosphatase-like phosphoesterase  29.67 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0678  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.03 
 
 
208 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.57 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
176 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0458  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.69 
 
 
245 aa  42  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000124469  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.36 
 
 
194 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3685  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.33 
 
 
299 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000286465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>