40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1124 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  58.12 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  57.38 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  59.02 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  58.33 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  59.02 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  57.26 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  57.26 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  55.65 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  55.2 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  55.2 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  55.2 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  54.76 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  51.69 
 
 		 123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  49.18 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  47.62 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  45.3 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  42.61 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  46.51 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  48.84 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  36.52 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  44.09 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  44.83 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  44.71 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  43.02 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  43.02 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  43.02 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  43.02 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  36.52 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  40.7 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  41.67 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  41.18 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  34.58 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  32.77 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  39.47 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  32.29 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3048  hypothetical protein  27.91 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>