40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2657 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  85.61 
 
 
132 aa  235  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  77.61 
 
 
135 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  77.61 
 
 
135 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  77.44 
 
 
134 aa  214  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  77.44 
 
 
134 aa  214  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  72.73 
 
 
131 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  67.19 
 
 
123 aa  188  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  63.41 
 
 
118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  60.8 
 
 
120 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  60.48 
 
 
127 aa  153  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  56.56 
 
 
123 aa  150  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  53.17 
 
 
127 aa  135  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  55.2 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  45.16 
 
 
121 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  34.13 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  45.56 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  44.76 
 
 
122 aa  87.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  34.92 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  43.33 
 
 
137 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  42.22 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  48.89 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  47.78 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  35.71 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  47.78 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  46.67 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  37.98 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  35.19 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  39.25 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  36.67 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  38.46 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  43.04 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  31.2 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3048  hypothetical protein  26.57 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>