38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3539 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  295  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  56.76 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  53.85 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  40.83 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  42.74 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  40.78 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  41.13 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  37.1 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  43.33 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  42.48 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  38.24 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  41.86 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  41.86 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  41.86 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  41.86 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  38.95 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  38.95 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  38.95 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  39.56 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  34.82 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  33.07 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  29.06 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  29.46 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  31.3 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  31.93 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  35.62 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  32.29 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  28.8 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  37.08 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  28.8 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  30.71 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  30.71 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>