40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1465 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  97.78 
 
 
134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  97.78 
 
 
134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  77.61 
 
 
132 aa  221  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  77.61 
 
 
132 aa  217  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  77.61 
 
 
132 aa  217  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  77.61 
 
 
132 aa  217  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  76.3 
 
 
131 aa  213  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  70.77 
 
 
123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  64.8 
 
 
118 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  60.77 
 
 
120 aa  164  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  57.69 
 
 
123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  59.52 
 
 
127 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  53.85 
 
 
127 aa  140  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  57.26 
 
 
118 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  40.8 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  48.39 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  44.86 
 
 
122 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  34.62 
 
 
124 aa  84.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  42.39 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  46.74 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  41.3 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  41.3 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  43.48 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  41.3 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  41.3 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  41.3 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  43.48 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  32.81 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  42.39 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  32.28 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  44.09 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  40.22 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  35.11 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  38.27 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3048  hypothetical protein  29.25 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  30.71 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>