39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3195 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  63.64 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  56.76 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  46.72 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  45.08 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  45.9 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  49.18 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  45.95 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  48.78 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  45.08 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  41.13 
 
 		 132 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  48.42 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  48.42 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  49.45 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  49.45 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  49.45 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  48.91 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  47.37 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  43.48 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  43.01 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  42.71 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  41.18 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  40.96 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  30.33 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  35.71 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  36.64 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  31.4 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  31.36 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  32.28 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  32.28 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  31.34 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>