40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1253 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  57.94 
 
 		 127 aa  160  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  61.6 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  61.6 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  60.48 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  60.48 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  60.48 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  58.54 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  59.52 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  59.52 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  57.48 
 
 		 123 aa  143  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  57.6 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  53.66 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  53.23 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  53.33 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  47.62 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  45.97 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  88.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  47.12 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  47.25 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  43.96 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  47.25 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  34.92 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  40.19 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  47.25 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  47.25 
 
 		 142 aa  84.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  46.15 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  31.5 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  40.66 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  40.66 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  40.66 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  40.66 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  38.18 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  38.46 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  38.46 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  35.48 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  29.46 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3048  hypothetical protein  28.71 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>