39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3296 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  249  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  68.29 
 
 		 123 aa  177  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  68.64 
 
 		 118 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  66.39 
 
 		 131 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  62.02 
 
 		 134 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  62.02 
 
 		 134 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  60.77 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  60.77 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  64.17 
 
 		 123 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  60.8 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  60.8 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  60.8 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  59.68 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  58.12 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  53.23 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  51.97 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  45.05 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  36.67 
 
 		 124 aa  91.3  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  45.05 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  47.96 
 
 		 122 aa  90.5  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  33.9 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  41.59 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  46.99 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  35.25 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  35.4 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  38.18 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  43.96 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  43.96 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  43.96 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  31.36 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  37.93 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  43.84 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  29.06 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>