39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1517 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  265  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  57.94 
 
 		 127 aa  160  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  54.26 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  54.26 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  53.85 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  53.85 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  56 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  53.17 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  53.17 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  51.94 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  53.17 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  51.97 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  49.21 
 
 		 123 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  48.46 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  53.04 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  49.18 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  43.2 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  50.55 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  40.8 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  42.59 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  49.45 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  46.15 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  47.25 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  45.05 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  47.25 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  46.15 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  33.06 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  41.3 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  43.96 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  42.71 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  40.66 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  35.4 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  32.8 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  39.47 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  37.08 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>