39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1356 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  99.29 
 
 
140 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  77.78 
 
 
141 aa  228  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  74.82 
 
 
142 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  79.14 
 
 
142 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  78.42 
 
 
142 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  78.42 
 
 
142 aa  201  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  70.73 
 
 
129 aa  201  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  73.39 
 
 
128 aa  184  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  63.28 
 
 
128 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  68 
 
 
128 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  62.69 
 
 
137 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  59.84 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  51.64 
 
 
142 aa  150  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.28 
 
 
124 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  46.72 
 
 
124 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  40.32 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  36.52 
 
 
118 aa  90.5  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  38.1 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  36.67 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  44.58 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  41.67 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  41.76 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  37.21 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  38.82 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  41.3 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  41.3 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  39.56 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  39.56 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  38.46 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  41.77 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  38.6 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>