40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1435 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  275  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  275  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  97.78 
 
 
135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  97.78 
 
 
135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  76.69 
 
 
132 aa  218  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  77.44 
 
 
132 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  77.44 
 
 
132 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  77.44 
 
 
132 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  76.12 
 
 
131 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  72.09 
 
 
123 aa  200  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  66.13 
 
 
118 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  62.02 
 
 
120 aa  166  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  58.14 
 
 
123 aa  161  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  61.6 
 
 
127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  54.26 
 
 
127 aa  144  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  59.02 
 
 
118 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  41.94 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  47.83 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  44.34 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  34.88 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  35.43 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  41.76 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  43.96 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  39.56 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  42.7 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  41.76 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  39.56 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  39.56 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  39.56 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  39.56 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  41.76 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  32.28 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  39.56 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  40.66 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  35.38 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  31.45 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  39.56 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  38.75 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  28.8 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3048  hypothetical protein  28.85 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>