21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3048 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  329  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  28.06 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  29.25 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  29.25 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  45.65 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  28.3 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  27.88 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  28.85 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  28.71 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  28.85 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  27.91 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  26.92 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  47.5 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  26.92 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  27.19 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  26.57 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  26.57 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  26.57 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  43.48 
 
 		 128 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1487  hypothetical protein  47.22 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.107863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>