More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0682 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0682  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
224 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2921  Glutathione S-transferase domain protein  60.44 
 
 
228 aa  291  7e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1541  Glutathione S-transferase domain protein  60.89 
 
 
228 aa  289  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2500  Glutathione S-transferase domain protein  58.67 
 
 
228 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2405  Glutathione S-transferase domain protein  57.78 
 
 
227 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0564  glutathione S-transferase-like  52.91 
 
 
227 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2127  glutathione S-transferase-like protein  51.1 
 
 
226 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2698  glutathione S-transferase-like protein  53.6 
 
 
227 aa  228  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  45.83 
 
 
218 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1259  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 
229 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  47.69 
 
 
228 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.22 
 
 
228 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3120  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.63 
 
 
215 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  45.79 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  44.7 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  45.33 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  45.85 
 
 
215 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0200  glutathione S-transferase  44.93 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.15 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  46.15 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.63 
 
 
215 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
218 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
218 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
218 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
215 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
215 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.88 
 
 
215 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3070  glutathione S-transferase-like  44.17 
 
 
218 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15979  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  45.15 
 
 
218 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
215 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
215 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
215 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  43.12 
 
 
219 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.66 
 
 
234 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.37 
 
 
231 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  46.12 
 
 
230 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.66 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  44.17 
 
 
229 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  43.69 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  43.69 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2898  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
215 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3154  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.62 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.861762  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  43.32 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.23 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  48.04 
 
 
214 aa  161  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  45.33 
 
 
227 aa  161  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  43.11 
 
 
229 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0374  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.17 
 
 
217 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3193  glutathione S-transferase-like protein  44.29 
 
 
222 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3826  Glutathione S-transferase domain  44.23 
 
 
215 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  43.41 
 
 
215 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1672  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.52 
 
 
217 aa  158  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  44.29 
 
 
219 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0990  Glutathione S-transferase domain protein  43.93 
 
 
227 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  44.66 
 
 
211 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.99 
 
 
229 aa  154  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  41.01 
 
 
220 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.75 
 
 
219 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.17 
 
 
209 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.95 
 
 
220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.95 
 
 
220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.95 
 
 
220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 
218 aa  151  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.66 
 
 
210 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250168 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  40.48 
 
 
220 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
220 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4314  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.46 
 
 
221 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0013  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 
218 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000975013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3336  glutathione S-transferase-like  42.86 
 
 
218 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0107  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.59 
 
 
241 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6895  Glutathione S-transferase domain  40.18 
 
 
217 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134635  normal  0.66105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2135  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.75 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.36 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0533093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0813  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.35 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0139942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  43.2 
 
 
229 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13360  glutathione S-transferase family protein  44.71 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2940  glutathione S-transferase  39.29 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05534  glutathione S-transferase  40.93 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3736  glutathione S-transferase  41.55 
 
 
217 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1566  glutathione S-transferase  39.25 
 
 
219 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0453975  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3437  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.23 
 
 
208 aa  141  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303772  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1959  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.69 
 
 
217 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399077  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2700  glutathione S-transferase-like protein  39.25 
 
 
218 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4092  glutathione S-transferase  40.78 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1217  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.72 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0763  glutathione S-transferase  39.72 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1840  glutathione S-transferase-like  38.32 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  38.24 
 
 
218 aa  138  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0742  glutathione S-transferase-like protein  40 
 
 
212 aa  138  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0491296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2755  glutathione S-transferase-like protein  38.24 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4398  glutathione S-transferase family protein  41.29 
 
 
260 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3619  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.81 
 
 
224 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.429528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  38.12 
 
 
220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1900  glutathione S-transferase-like protein  37.75 
 
 
218 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3732  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.62 
 
 
239 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4632  glutathione S-transferase-like  37.62 
 
 
239 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517858  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0580  glutathione S-transferase-like  38.67 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3789  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.13 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181151  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2984  hypothetical protein  40.38 
 
 
232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4502  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.2 
 
 
210 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282964  normal  0.694536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>