More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0933 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  424  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13360  glutathione S-transferase family protein  69.67 
 
 
214 aa  289  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.73 
 
 
209 aa  278  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  62.86 
 
 
211 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4502  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.43 
 
 
210 aa  264  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282964  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4092  glutathione S-transferase  60.87 
 
 
208 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4377  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.35 
 
 
210 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal  0.0169284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0954  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.57 
 
 
210 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4398  glutathione S-transferase family protein  59.41 
 
 
260 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4426  glutathione S-transferase-like protein  56.19 
 
 
210 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1347  glutathione S-transferase family protein  60.77 
 
 
210 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114443  hitchhiker  0.00114308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  52.38 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  51.43 
 
 
229 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  50.95 
 
 
229 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  50 
 
 
219 aa  203  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  50.72 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  49.05 
 
 
229 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  50.72 
 
 
218 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3070  glutathione S-transferase-like  49.28 
 
 
218 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15979  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  48.33 
 
 
218 aa  192  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  49.55 
 
 
234 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  48.31 
 
 
217 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2898  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.03 
 
 
215 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  49.05 
 
 
229 aa  187  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  49.28 
 
 
214 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3336  glutathione S-transferase-like  51.67 
 
 
218 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  46.89 
 
 
218 aa  182  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0200  glutathione S-transferase  47.85 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  49.07 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0374  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.61 
 
 
217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3154  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.98 
 
 
227 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.861762  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.73 
 
 
231 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.28 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3193  glutathione S-transferase-like protein  49.49 
 
 
222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.13 
 
 
228 aa  178  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4314  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.55 
 
 
221 aa  177  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0763  glutathione S-transferase  48.28 
 
 
217 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.33 
 
 
215 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  48.33 
 
 
215 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  48.33 
 
 
215 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1959  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.8 
 
 
217 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399077  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2700  glutathione S-transferase-like protein  48.53 
 
 
218 aa  175  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.37 
 
 
215 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6895  Glutathione S-transferase domain  45.37 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134635  normal  0.66105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  46.51 
 
 
230 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.89 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1217  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.1 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.15 
 
 
218 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.15 
 
 
215 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.15 
 
 
218 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.15 
 
 
218 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.15 
 
 
215 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.15 
 
 
215 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.67 
 
 
234 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2940  glutathione S-transferase  44.39 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.67 
 
 
215 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4995  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.34 
 
 
218 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3120  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.37 
 
 
215 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1900  glutathione S-transferase-like protein  45.32 
 
 
218 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2755  glutathione S-transferase-like protein  47.06 
 
 
218 aa  168  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  43.38 
 
 
227 aa  168  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.19 
 
 
219 aa  167  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.76 
 
 
220 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.24 
 
 
220 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0580  glutathione S-transferase-like  43.66 
 
 
224 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  45.32 
 
 
215 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.76 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.79 
 
 
215 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  44.29 
 
 
220 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  42.86 
 
 
220 aa  165  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1672  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.51 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.37 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0241  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.59 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.55 
 
 
229 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  45.59 
 
 
218 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0013  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000975013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.54 
 
 
218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  48.04 
 
 
220 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3614  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.55 
 
 
220 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.922528  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3736  glutathione S-transferase  46.63 
 
 
217 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6278  putative maleylacetoacetate isomerase (MAAI) (glutathione S- transferase)  44.5 
 
 
217 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0107  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.93 
 
 
241 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3732  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.57 
 
 
239 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.73 
 
 
228 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4632  glutathione S-transferase-like  46.57 
 
 
239 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3789  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.57 
 
 
220 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181151  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0990  Glutathione S-transferase domain protein  45.12 
 
 
227 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1566  glutathione S-transferase  45.37 
 
 
219 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0453975  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.06 
 
 
218 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0533093 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4069  putative glutathione-S-transferase protein  45.05 
 
 
218 aa  158  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4030  putative glutathione-S-transferase protein  45.45 
 
 
240 aa  158  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388336  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3775  putative glutathione-S-transferase protein  45.05 
 
 
218 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3437  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.63 
 
 
208 aa  158  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303772  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05534  glutathione S-transferase  42.23 
 
 
215 aa  158  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  44.5 
 
 
219 aa  157  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3826  Glutathione S-transferase domain  43.41 
 
 
215 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0624  Glutathione S-transferase domain protein  44.33 
 
 
217 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101229 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3377  glutathione S-transferase family protein  45.27 
 
 
294 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1840  glutathione S-transferase-like  42.65 
 
 
244 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2135  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.61 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>