More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1217 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1217  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2700  glutathione S-transferase-like protein  68.04 
 
 
218 aa  316  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2755  glutathione S-transferase-like protein  66.67 
 
 
218 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1959  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.82 
 
 
217 aa  309  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399077  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2940  glutathione S-transferase  68.52 
 
 
217 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6895  Glutathione S-transferase domain  68.98 
 
 
217 aa  308  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134635  normal  0.66105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0763  glutathione S-transferase  66.2 
 
 
217 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1840  glutathione S-transferase-like  63.89 
 
 
244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  63.55 
 
 
218 aa  304  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4314  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.06 
 
 
221 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.18 
 
 
220 aa  300  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1566  glutathione S-transferase  63.59 
 
 
219 aa  295  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0453975  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3732  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.22 
 
 
239 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4632  glutathione S-transferase-like  64.22 
 
 
239 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  63.01 
 
 
220 aa  294  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3789  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.22 
 
 
220 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181151  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1900  glutathione S-transferase-like protein  63.59 
 
 
218 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3614  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.84 
 
 
220 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.922528  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0624  Glutathione S-transferase domain protein  66.2 
 
 
217 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2135  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.86 
 
 
216 aa  277  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6278  putative maleylacetoacetate isomerase (MAAI) (glutathione S- transferase)  64.36 
 
 
217 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1488  putative glutathione-S-transferase protein  55.09 
 
 
218 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4995  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.01 
 
 
218 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0682  putative glutathione-S-transferase protein  55.14 
 
 
218 aa  238  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.994031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4069  putative glutathione-S-transferase protein  55.61 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3775  putative glutathione-S-transferase protein  55.61 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102051  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4030  putative glutathione-S-transferase protein  55.35 
 
 
240 aa  231  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388336  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2898  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.23 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  46.6 
 
 
229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  46.19 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0200  glutathione S-transferase  46.34 
 
 
217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  45.62 
 
 
218 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  46.23 
 
 
229 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  45.75 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  45.63 
 
 
229 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  45.85 
 
 
211 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.08 
 
 
215 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  46.26 
 
 
219 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0954  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.08 
 
 
210 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  46.54 
 
 
218 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4502  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.61 
 
 
210 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282964  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.32 
 
 
234 aa  174  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4377  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.59 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal  0.0169284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3070  glutathione S-transferase-like  45.62 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15979  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  43.6 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  42.27 
 
 
234 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4092  glutathione S-transferase  44.61 
 
 
208 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.1 
 
 
210 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
231 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.13 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  43.13 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.35 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.6 
 
 
215 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
209 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.35 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.35 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.35 
 
 
215 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.35 
 
 
215 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.35 
 
 
215 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.65 
 
 
215 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.35 
 
 
215 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.13 
 
 
215 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  41.4 
 
 
220 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  41.55 
 
 
227 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  43.4 
 
 
215 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  42.86 
 
 
218 aa  165  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.63 
 
 
220 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13360  glutathione S-transferase family protein  42.92 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  41.63 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.15 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.63 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0013  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.66 
 
 
218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000975013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  39.91 
 
 
228 aa  161  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  43.32 
 
 
218 aa  161  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3193  glutathione S-transferase-like protein  42.33 
 
 
222 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.84 
 
 
228 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3826  Glutathione S-transferase domain  42.92 
 
 
215 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.64 
 
 
229 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.59 
 
 
219 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.59 
 
 
218 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4398  glutathione S-transferase family protein  43.15 
 
 
260 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3154  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.63 
 
 
227 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.861762  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  40.54 
 
 
230 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3736  glutathione S-transferase  42.99 
 
 
217 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.44 
 
 
228 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  40.85 
 
 
217 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  45.15 
 
 
229 aa  158  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2921  Glutathione S-transferase domain protein  41.09 
 
 
228 aa  157  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3120  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.71 
 
 
215 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1259  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.25 
 
 
229 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.59 
 
 
218 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0533093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1541  Glutathione S-transferase domain protein  41.12 
 
 
228 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1347  glutathione S-transferase family protein  45.59 
 
 
210 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114443  hitchhiker  0.00114308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4426  glutathione S-transferase-like protein  42.16 
 
 
210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0613  Glutathione S-transferase domain  41.43 
 
 
222 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  40.09 
 
 
219 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0990  Glutathione S-transferase domain protein  41.31 
 
 
227 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0241  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.52 
 
 
227 aa  148  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0374  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.97 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3336  glutathione S-transferase-like  41.78 
 
 
218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>