260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0107 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0107  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
241 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  61.25 
 
 
227 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.42 
 
 
228 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0990  Glutathione S-transferase domain protein  62.5 
 
 
227 aa  292  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  60.67 
 
 
234 aa  288  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  60.08 
 
 
230 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.51 
 
 
228 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  58.09 
 
 
228 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.07 
 
 
229 aa  278  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.17 
 
 
231 aa  274  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1259  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.97 
 
 
229 aa  251  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  48.75 
 
 
229 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  48.33 
 
 
229 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  46.86 
 
 
229 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  45.42 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2898  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.64 
 
 
215 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  48.75 
 
 
229 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2921  Glutathione S-transferase domain protein  46.05 
 
 
228 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2405  Glutathione S-transferase domain protein  47.74 
 
 
227 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1541  Glutathione S-transferase domain protein  46.05 
 
 
228 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0200  glutathione S-transferase  48.46 
 
 
217 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.92 
 
 
215 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.48 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  45.73 
 
 
215 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.44 
 
 
215 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 
218 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.02 
 
 
215 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 
218 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 
218 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  45.3 
 
 
215 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13360  glutathione S-transferase family protein  46.12 
 
 
214 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.3 
 
 
215 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 
215 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 
215 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 
215 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 
215 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  45.81 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.3 
 
 
215 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  44.49 
 
 
219 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  44.78 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  45.78 
 
 
218 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  38.66 
 
 
220 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4632  glutathione S-transferase-like  42.54 
 
 
239 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3732  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.54 
 
 
239 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.93 
 
 
210 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3789  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.54 
 
 
220 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181151  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2500  Glutathione S-transferase domain protein  43.81 
 
 
228 aa  168  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  42.54 
 
 
220 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3070  glutathione S-transferase-like  44.89 
 
 
218 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15979  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2698  glutathione S-transferase-like protein  45.54 
 
 
227 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2940  glutathione S-transferase  42.54 
 
 
217 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6895  Glutathione S-transferase domain  42.98 
 
 
217 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134635  normal  0.66105 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  44.05 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3736  glutathione S-transferase  46.26 
 
 
217 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  43.04 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3193  glutathione S-transferase-like protein  47.44 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0013  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.14 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000975013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  44.3 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  44.49 
 
 
219 aa  161  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4502  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.23 
 
 
210 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282964  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.71 
 
 
219 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3614  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.67 
 
 
220 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.922528  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4314  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.42 
 
 
221 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.39 
 
 
220 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3336  glutathione S-transferase-like  44.49 
 
 
218 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.71 
 
 
218 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4377  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.23 
 
 
210 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal  0.0169284 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.39 
 
 
220 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.39 
 
 
220 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.29 
 
 
218 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0533093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  36.97 
 
 
220 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0954  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.36 
 
 
210 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.98 
 
 
209 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1217  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.26 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4092  glutathione S-transferase  42.11 
 
 
208 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.05 
 
 
220 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1566  glutathione S-transferase  41.48 
 
 
219 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0453975  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0564  glutathione S-transferase-like  41.7 
 
 
227 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2700  glutathione S-transferase-like protein  41.33 
 
 
218 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3437  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.39 
 
 
208 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303772  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1840  glutathione S-transferase-like  39.83 
 
 
244 aa  151  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  44.39 
 
 
215 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  39.47 
 
 
218 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05534  glutathione S-transferase  36.48 
 
 
215 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2755  glutathione S-transferase-like protein  39.47 
 
 
218 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0241  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.93 
 
 
227 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0682  putative glutathione S-transferase  41.59 
 
 
224 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3826  Glutathione S-transferase domain  42.67 
 
 
215 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2984  hypothetical protein  39.59 
 
 
232 aa  148  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4398  glutathione S-transferase family protein  41.36 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0763  glutathione S-transferase  42.92 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3120  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.22 
 
 
215 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2135  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.56 
 
 
216 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0580  glutathione S-transferase-like  39.67 
 
 
224 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0624  Glutathione S-transferase domain protein  39.39 
 
 
217 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2127  glutathione S-transferase-like protein  40.17 
 
 
226 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1672  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.51 
 
 
217 aa  141  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1959  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.12 
 
 
217 aa  141  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399077  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0374  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.8 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4426  glutathione S-transferase-like protein  39.21 
 
 
210 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>