More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0990 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0990  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  69.6 
 
 
227 aa  342  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  66.08 
 
 
228 aa  322  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.08 
 
 
228 aa  321  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.96 
 
 
229 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  65.22 
 
 
230 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  65.49 
 
 
234 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.88 
 
 
231 aa  308  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.79 
 
 
228 aa  304  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1259  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.39 
 
 
229 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0107  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.5 
 
 
241 aa  292  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  54.82 
 
 
229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  52.65 
 
 
229 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  51.56 
 
 
229 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  51.33 
 
 
229 aa  224  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  50 
 
 
229 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.67 
 
 
218 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.67 
 
 
215 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.67 
 
 
218 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.67 
 
 
215 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.67 
 
 
218 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0200  glutathione S-transferase  49.09 
 
 
217 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.67 
 
 
215 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.22 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.22 
 
 
234 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2921  Glutathione S-transferase domain protein  49.07 
 
 
228 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  47.17 
 
 
218 aa  191  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  47.49 
 
 
218 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3070  glutathione S-transferase-like  46.58 
 
 
218 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15979  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1541  Glutathione S-transferase domain protein  48.6 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2898  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.85 
 
 
215 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  46.73 
 
 
218 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.84 
 
 
215 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  45.07 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  45.7 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.05 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.5 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  42.6 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.8 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.5 
 
 
220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.34 
 
 
215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  41.07 
 
 
220 aa  181  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  46.7 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.25 
 
 
215 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  45.25 
 
 
215 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2405  Glutathione S-transferase domain protein  47.91 
 
 
227 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.25 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3736  glutathione S-transferase  50 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  46.79 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2500  Glutathione S-transferase domain protein  47.66 
 
 
228 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3336  glutathione S-transferase-like  47.64 
 
 
218 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2940  glutathione S-transferase  44.86 
 
 
217 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4314  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.7 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6895  Glutathione S-transferase domain  45.28 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134635  normal  0.66105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0013  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000975013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0374  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.2 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1672  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.81 
 
 
217 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252264 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05534  glutathione S-transferase  40.64 
 
 
215 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  42.92 
 
 
218 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3437  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.33 
 
 
208 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303772  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 
218 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.64 
 
 
218 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0533093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3193  glutathione S-transferase-like protein  46.26 
 
 
222 aa  168  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.01 
 
 
219 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3120  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.58 
 
 
215 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.12 
 
 
210 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250168 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2698  glutathione S-transferase-like protein  46.23 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2135  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.52 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  42.66 
 
 
215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3154  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.84 
 
 
227 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.861762  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  39.91 
 
 
211 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4502  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.33 
 
 
210 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282964  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  43.93 
 
 
220 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1217  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.31 
 
 
219 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0624  Glutathione S-transferase domain protein  41.51 
 
 
217 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3826  Glutathione S-transferase domain  42.86 
 
 
215 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3732  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.25 
 
 
239 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4632  glutathione S-transferase-like  42.25 
 
 
239 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
209 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4092  glutathione S-transferase  41.12 
 
 
208 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3789  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.06 
 
 
220 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181151  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13360  glutathione S-transferase family protein  38.43 
 
 
214 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3614  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.99 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.922528  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0682  putative glutathione S-transferase  43.93 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4377  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.4 
 
 
210 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal  0.0169284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2755  glutathione S-transferase-like protein  41.31 
 
 
218 aa  154  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0763  glutathione S-transferase  40 
 
 
217 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4995  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.59 
 
 
218 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0954  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.47 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1959  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 
217 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399077  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4398  glutathione S-transferase family protein  41.26 
 
 
260 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  41.47 
 
 
214 aa  151  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.2 
 
 
220 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1900  glutathione S-transferase-like protein  39.34 
 
 
218 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  40.28 
 
 
218 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2700  glutathione S-transferase-like protein  39.35 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0580  glutathione S-transferase-like  39.17 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6278  putative maleylacetoacetate isomerase (MAAI) (glutathione S- transferase)  40.19 
 
 
217 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1566  glutathione S-transferase  41.12 
 
 
219 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0453975  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0241  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
227 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>