169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2929 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2929  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 
312 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1458  flagellar motor switch protein FliM  34.33 
 
 
331 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  26.81 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  24.26 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  25.84 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  28.04 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  28.04 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  24.28 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  26.5 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  27.5 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  25.62 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  26.35 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  26.57 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  25.35 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  28.98 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  26.26 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  26.2 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  25.54 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  24.91 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  25.79 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  24.28 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  26.84 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  24.37 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  25.74 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  25.82 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  24.91 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  25.09 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  20.71 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  24.91 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  24.91 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1756  flagellar motor switch protein FliM  24 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  24.91 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  27.4 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  21.19 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  27.68 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  26.43 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0060  flagellar switch protein FliM  22.85 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0400125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  23.99 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1695  surface presentation of antigens (SPOA) protein  22.85 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000545109 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  21.33 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1756  flagellar motor switch protein FliM  22.97 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  22.88 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  24.16 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  24.33 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  26.57 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1648  surface presentation of antigens (SPOA) protein  22.85 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241554  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  22.22 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  25.09 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  23.02 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  26.38 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  25.4 
 
 
332 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  25.19 
 
 
323 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 
395 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  25.19 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  23.63 
 
 
325 aa  62.4  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  22.88 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  23.19 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  21.94 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  23.19 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  23.19 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  25.36 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  23.83 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  21.98 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  23.83 
 
 
337 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  24.65 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  22.79 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  23.38 
 
 
332 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  23.38 
 
 
332 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  23.19 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  24.63 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  24.57 
 
 
401 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  23.02 
 
 
331 aa  59.3  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  23.08 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  23.08 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  23.08 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  23.08 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  23.34 
 
 
334 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  22.01 
 
 
372 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  23.62 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  23.34 
 
 
334 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0329875 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>