108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1737 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1737  Redoxin domain protein  100 
 
 
151 aa  306  5e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000935859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  29.23 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  29.23 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  29.23 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  35.71 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  29.66 
 
 
165 aa  53.9  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.52 
 
 
192 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  29.66 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1248  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.49 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1646  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.49 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.62 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  34.38 
 
 
211 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.13 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  31.36 
 
 
198 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4071  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.49 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.65049  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0011  hypothetical protein  26.17 
 
 
156 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0183  Redoxin domain protein  30.07 
 
 
154 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0011  hypothetical protein  26.17 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.06 
 
 
193 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1208  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.56 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  28.47 
 
 
201 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.2 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0354  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.97 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0367  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.97 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  29.01 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  29.01 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.91 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  27.03 
 
 
192 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.27 
 
 
445 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  29.55 
 
 
403 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  25.19 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4555  thioredoxin  25.83 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.68 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.68 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  30.83 
 
 
301 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.36 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  29.55 
 
 
403 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.72 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  27.68 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  31.3 
 
 
170 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.33 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5749  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
380 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566272  normal  0.459715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51930  thioredoxin  25.69 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  24.68 
 
 
306 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  24.68 
 
 
316 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2614  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.58 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3658  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.35 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  24.59 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  29.23 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  28.32 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  24.68 
 
 
316 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2837  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  24.58 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0709911  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  27.56 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0915  redoxin domain-containing protein  23.21 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.77 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  27.87 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.83 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00388895  normal  0.0679013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  28.57 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6596  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.19 
 
 
202 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.98 
 
 
173 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4009  Redoxin domain protein  32.46 
 
 
636 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598188  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1688  thioredoxin, putative  29.01 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3701  thioredoxin, putative  27.33 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.304862  decreased coverage  0.000242326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  24.03 
 
 
332 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.43 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  28.32 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  23.61 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  24.03 
 
 
305 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0180  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  26.27 
 
 
195 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
375 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4550  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
487 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00323854  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1788  Redoxin domain protein  25.86 
 
 
162 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  28.16 
 
 
437 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  23.61 
 
 
197 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36790  thioredoxin  24.78 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1710  Redoxin domain protein  21.33 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3457  hypothetical protein  26.97 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1453  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.77 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  26.19 
 
 
173 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  28.71 
 
 
193 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  24.03 
 
 
306 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  25.36 
 
 
174 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  26.19 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3503  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.4 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  23.88 
 
 
165 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2644  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.81 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0773  Redoxin domain protein  25 
 
 
323 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  28.33 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  26.52 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0463  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  22.83 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  29.2 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.07 
 
 
206 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5340  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.45 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.56 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  25.41 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  34 
 
 
219 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  29.41 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2085  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.19 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1003  periplasmic protein thiol  21.77 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0767014  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  23.38 
 
 
306 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>