More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0265 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0265  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 128 aa  176  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0448  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 130 aa  174  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000201817  hitchhiker  0.00276922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 		 131 aa  173  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  65.32 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  66.13 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  66.13 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  66.13 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  65.32 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  65.32 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  65.32 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  64.52 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  65.32 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  65.32 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  65.32 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  70.99 
 
 		 131 aa  169  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  65.32 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  64.06 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  64.84 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  61.72 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  63.36 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  64.52 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  63.36 
 
 		 130 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  61.72 
 
 		 131 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  167  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 		 130 aa  166  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  58.4 
 
 		 133 aa  166  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  60.32 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 		 130 aa  166  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  58.4 
 
 		 133 aa  166  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  58.4 
 
 		 133 aa  166  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 		 130 aa  166  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2349  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  56 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  61.07 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  61.07 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  61.07 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  57.69 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  63.79 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>