201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0089 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0374  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4412    96.36 
 
 		 1673 bp  2093    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000157405  normal  0.0192173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2346    94.6 
 
 		 426 bp  662    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.651807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0495  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3584  integrase catalytic region  97.65 
 
 		 810 bp  1455    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0657  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0684  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3113  integrase catalytic region  97.65 
 
 		 810 bp  1455    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4653  integrase catalytic region  96.14 
 
 		 690 bp  1130    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0892  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2548  integrase catalytic region  97.16 
 
 		 810 bp  1423    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0983  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1024  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  96.29 
 
 		 1160 bp  1959    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1079  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  96.29 
 
 		 1160 bp  1959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2818  integrase catalytic region  97.65 
 
 		 810 bp  1455    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00277944  normal  0.404607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1083  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1129  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4401  transposase IS3/IS911 family protein  96 
 
 		 1040 bp  1705    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.518435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1727  integrase catalytic subunit  95.8 
 
 		 810 bp  1336    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3065  integrase catalytic subunit  95.8 
 
 		 810 bp  1336    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174203  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1134  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  96.29 
 
 		 1160 bp  1959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1465  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1556  integrase catalytic region  97.65 
 
 		 810 bp  1455    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1515  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1904  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  96.29 
 
 		 1160 bp  1959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  96.29 
 
 		 1160 bp  1959    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2026  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2031  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  96.29 
 
 		 1160 bp  1959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2056  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  97.26 
 
 		 3081 bp  3029    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2130  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2660  integrase catalytic subunit  95.68 
 
 		 810 bp  1328    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306484  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  96.29 
 
 		 1160 bp  1959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2135  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  96.29 
 
 		 1160 bp  1959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2169  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2171  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4596  integrase catalytic region  96.54 
 
 		 810 bp  1384    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.930794 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4660  integrase catalytic region  96.54 
 
 		 810 bp  1384    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.462988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2315  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3189  integrase catalytic subunit  95.8 
 
 		 810 bp  1336    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2369  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2462  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0991    96.36 
 
 		 6392 bp  2091    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1332  integrase catalytic region  97.65 
 
 		 810 bp  1455    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2734  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0656  integrase catalytic subunit  95.8 
 
 		 810 bp  1336    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  96.29 
 
 		 1160 bp  1959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3398  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1073  integrase catalytic subunit  95.8 
 
 		 810 bp  1336    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2006  integrase catalytic subunit  95.8 
 
 		 810 bp  1336    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373277  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4460  integrase catalytic subunit  95.8 
 
 		 810 bp  1336    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4449  integrase catalytic subunit  95.68 
 
 		 810 bp  1328    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0972291  normal  0.591502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  97.16 
 
 		 3087 bp  3033    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2305  integrase catalytic region  97.65 
 
 		 810 bp  1455    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.209191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3570  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3606  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1740  integrase catalytic region  97.65 
 
 		 810 bp  1455    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.453724  normal  0.15404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2651  integrase catalytic subunit  95.8 
 
 		 810 bp  1336    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3610  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4183  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4312  integrase catalytic subunit  95.56 
 
 		 756 bp  1211    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4277  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2987  integrase catalytic region  97.53 
 
 		 810 bp  1447    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  97.26 
 
 		 3081 bp  3029    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4294  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4300  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4231  integrase catalytic region  97.65 
 
 		 810 bp  1455    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  93.95 
 
 		 810 bp  1217    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3550  integrase catalytic subunit  95.8 
 
 		 810 bp  1336    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4442  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4580  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  97.06 
 
 		 3087 bp  2970    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1118  integrase catalytic subunit  95.68 
 
 		 810 bp  1328    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0024  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0483506  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  100 
 
 		 1160 bp  2300    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  99.91 
 
 		 1160 bp  2292    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0029  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0037  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  99.91 
 
 		 1160 bp  2292    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  99.91 
 
 		 1160 bp  2292    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0054  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  100 
 
 		 1160 bp  2300    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0066  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4448    91.38 
 
 		 544 bp  712    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379611  normal  0.756151 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0089    100 
 
 		 4317 bp  8558    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  100 
 
 		 1160 bp  2300    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0091  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 810 bp  1606    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0092    100 
 
 		 1611 bp  3194    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1928  integrase catalytic subunit  95.68 
 
 		 810 bp  1328    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0145  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 		 645 bp  1221    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0146    99.9 
 
 		 2461 bp  1907    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2008  integrase catalytic subunit  95.68 
 
 		 810 bp  1328    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106721  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0425  integrase catalytic subunit  93.95 
 
 		 810 bp  1217    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  93.95 
 
 		 810 bp  1217    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>